贵国企收购民企时涉及房产转移的合法性，需依据《中华人民共和国物权法》（2007年10月1日起施行）第十四条的规定进行分析。
《中华人民共和国物权法》第十四条明确规定：“不动产物权的设立、变更、转让和消灭，依照法律规定应当登记的，自记载于不动产登记簿时发生效力。”在贵国企收购民企的场景中，若目标公司（民企）已将房产登记在其名下，则房产的所有权归目标公司所有。股权协议签订仅代表股权交易的达成，并不直接导致房产所有权的转移。若要在股权协议签订后由对方（原民企股东或目标公司）转移房产，必须完成不动产登记转移手续，否则不发生物权效力。若房产未登记在目标公司名下，对方转移房产需确保未违反股权协议约定，且符合物权法关于不动产转移的登记要求。综上，房产转移的核心在于是否完成登记，股权协议签订本身不影响房产的物权转移效力。
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贵国企收购民企时，若对方在股权协议签订后转移房产，可能面临以下法律风险：
1. 房产转移无效的风险：若目标公司（民企）未通过合法程序（如股东会决议）转移房产，或未完成不动产登记，房产转移行为可能被认定为无效，贵国企收购后仍需承担房产相关的责任。例如，目标公司未经股东会决议将房产转移给原股东，其他股东可能主张该转移行为无效，要求恢复房产所有权。
2. 资产流失的风险：若对方以明显低于市场价格转移房产，可能涉及国有资产流失（若贵国企为国有控股）。例如，目标公司将价值1000万元的房产以500万元转让给关联方，贵国企收购后发现该情况，可能面临监管部门的调查和处罚。
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贵国企收购民企时，房产转移问题可能存在以下特殊情况或例外情形，影响处理结果：
1. 房产已设定抵押：若目标公司的房产已抵押给金融机构，对方转移房产需经抵押权人同意，否则无法完成登记。此时，贵国企需与目标公司及抵押权人协商，提前清偿债务或变更抵押，否则房产无法顺利转移。
2. 房产涉及诉讼或查封：若房产因目标公司的债务纠纷被法院查封，对方无法转移房产，需先解决诉讼纠纷或解除查封，才能进行房产转移。这可能导致股权收购的进度延迟，甚至影响收购的可行性。
3. 股权协议中的特殊约定：若股权协议中约定目标公司需在收购后保留房产，或对房产转移作出限制性约定，则对方不得随意转移房产。此时，贵国企需与对方协商修改协议条款，明确房产转移的条件和时间。
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针对贵国企收购民企时不想接收对方房产、能否在股权协议签订后由对方转移房产的问题，答案需结合法律规定和具体情况分析。
股权协议签订后对方能否转移房产，关键取决于房产是否已成为目标公司（民企）的资产及转移行为是否合法。
1. 若目标公司（民企）已合法持有房产所有权：此时房产属于目标公司的资产，股权收购完成后，目标公司成为贵国企的子公司或控股公司，其资产（包括房产）归目标公司所有。若要转移房产，需经目标公司股东会或董事会决议（具体依公司章程），且需符合《公司法》关于公司资产处置的规定，同时完成不动产登记转移手续。
2. 若目标公司（民企）尚未完成房产所有权登记：若房产仍登记在原产权人名下（非目标公司），则目标公司不享有房产所有权，对方（原产权人）可在股权协议签订后自行转移房产，但需确保该房产未被列入股权收购的资产范围，且股权协议中未对该房产的归属作出限制性约定。

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